OISTは沖縄における高成長のベンチャービジネスの創生も推進しており、ネットワークの構築や起業家活動の促進を目的としたセミナーやワークショップを開催しています。更に、OISTの研究から派生する有望なプロジェクトの直接的な支援も行っています。 また、OIST Innovation Accelerator（起業家支援プログラム）やOIST Innovation Incubator（インキュベーション施設）などのプログラム、イベント、施設、サービスを通じて、スタートアップを幅広く支援しています。OISTは、世界的な課題の解決を目指す革新的な技術を持つアーリーステージのスタートアップを誘致し、支援しています。
スタートアップ支援
アクセラレータープログラム
OIST Innovationアクセラレーターは、沖縄県の支援のもとに誕生した、沖縄初のグローバルスタートアップアクセラレータープログラムです。世界中から集まる応募者の中から、革新的な技術を持つ起業家が選ばれ、約10か月間OISTに滞在し、OISTの人材、設備、リソースを活用しながら、沖縄での企業設立や事業の成長を目指します。参加者には最大1000万円のNon-Equity型資金が提供されるほか、メンタリングや企業・投資家とのマッチング支援も行われます。本プログラムを通じて、OISTは世界中から優れた起業家を集め、大学周辺のイノベーションエコシステムを強化し、地域の持続可能な経済発展に貢献することを目指しています。
インキュベーション施設
OIST Innovationインキュベーターは、共有オフィスに加え、共有機器と共有ラボを備える、創業初期のディープテックスタートアップのためのインキュベーション施設です。起業家が事業の可能性を評価し、プロトタイプを開発するための環境を提供しています。
アントレプレナーシッププログラム
OISTでは学内の研究者の起業家精神の育成を目的として、外部から講師を招き、アントレプレナーシップに関する基礎的な講座を定期的に開催しています。
メンタリングサービス
OISTでは、起業家や研究者に対して、MITのメンターリングサービス（MIT Venture Mentoring Service）のメソッドを取り入れたメンタープログラムを提供しています。本プログラムの特徴は、2～4名のメンターによるチームメンタリングと、経験豊富で利害関係のないメンターがボランティアとして参加する点です。これにより、専門家からの実践的なアドバイスを通じて、研究者や起業家がプロジェクトや事業を次のステージへ進める支援を行っています。
ベンチャーキャピタルファンド
OIST-Lifetime Ventures Fund は、OISTとライフタイムベンチャーズが連携して設立したファンドです。 Health & AgeTech（ヘルスケア・医療・介護・高齢化とテクノロジーの融合）、Future of Work（テクノロジーを活用した働き方の変革）、 Sustainable Living（地球環境と調和の取れた生活を実現するテクノロジー）、Blue Economy（海の健康を守りながら発展する新しい海洋産業）などの分野で、社会に大きなインパクトを与えるディープテック・ソリューションの創出を目指しています。
