ゲノムアセンブリの手法

生物が生命活動を維持するために必要な遺伝情報を「ゲノム」という。ゲノム解読では、個々の細胞からDNAを取り出し、断片化して解析し、そのDNA配列の断片を再構築してゲノムアセンブリを得る。有性生殖を行う動物は、母親と父親からそれぞれ1セットずつゲノムを受け継ぐ。片方の親に由来する１セットのゲノム情報を「ハプロタイプ」という。(i）系統が確立した実験生物や遺伝的多様性が低い種では、1個体がほぼ同一のゲノムを2セット持っているため、ハプロタイプ同士を混ぜ合わせて再構築したゲノムアセンブリは、元の2セットのゲノムの両方に類似することになる。(ii）野生動物のように遺伝的多様性が高い生物では、ハプロタイプ間のDNA配列に大きな違いがあるため、従来のように2つのハプロタイプを混ぜ合わせてゲノムアセンブリを再構築すると、一部のゲノム情報が損なわれる可能性がある。(iii) 本研究では、最新のシーケンサーを用いることで、高精度で長いDNA配列決定が行われた。研究チームは、2つのハプロタイプのゲノムを別々に再構築した。

ゲノムの多様性が真珠貝を病気から守る