バイオインフォマティクスサポートスペシャリスト

ポジション

コアファシリティの科学計算及びデータ解析セクション(以下:SCDA)では、OISTの研究者や学生に向けて、HPC(ハイパフォーマンスコンピューティング)クラスタの効果的な利用を推進しています。SCDAはOIST内の研究に必要な計算資源とサービスを統合的に管理し、研究で行う負荷の高い様々な計算(大規模計算、大量計算など)をサポートしています。サポートの対象となる研究分野は、生物情報学から計算物理学まで多岐にわたります。

バイオインフォマティクスサポートスペシャリストは、SCDAリーダーの指示のもと、ゲノミクス、計算生物学、バイオインフォマティクスのユーザーやシーケンシングセクションなどの他のコアファシリティセクションにコンサルティングとサポートサービスを提供することで、OISTの充実した科学計算サービスの利用を強化します。

本ポジションの募集は、本学が日本学術振興会から採択を受けた「地域中核・特色ある研究大学強化促進事業(J-PEAKS)助成金」を財源としています。

OISTについて

沖縄科学技術大学院大学は、世界の科学技術の発展に貢献し、沖縄でのイノベーションの拠点となるために2011年に設立されました。5年一貫制の博士課程教育を提供し、国を超えて、分野を超えて、優れた研究者が共同で、最先端の科学研究を行っています。

85 ヘクタールの敷地に広がる大自然の中に設立され、美しい海岸とサンゴ礁を見下ろす場所に位置します。キャンパスは建築学的観点から見ても印象的なこだわりが施され、その自然の中にある大学施設を際立たせています。学部の壁を作らないことで、学際的な研究成果を生み出せる環境を提供し、また学内の誰もが、最高水準のリソースへのアクセスと研究機器の利用が可能で、共同研究に生かせるような仕組みを整えています。

学内では英語を公用語とし、50 ヵ国以上から集まる研究者コミュニティは真の国際性を保持しています。OISTは科学技術の革新、そして沖縄の経済発展の原動力となるイノベーション創出に取り組んでいます。

職責
  1. バイオインフォマティクス ソフトウェアとコンピューティングのニーズに関するユーザーをサポート
    • HPCシステム上でのオープンソースソフトウェアとデータベースのインストールと保守。
    • さまざまなバイオインフォマティクスツールと手法に関するコンサルティングなど
  2. ユーザーのワークフローと特定の利用事例に対して二次レベルのサポートを提供
  3. 他のコアファシリティセクションと協力し、バイオインフォマティクス関連のユーザーグループのプロジェクトの成果物や、マイルストーンのサポート。バイオインフォマティクス関連のシステム調達に関する他部門やユーザーへの助言
  4. 機器から出力されるデータの転送やその受け渡し、リモート設定などネットワーク関連の整備サポート
  5. ユーザー向け文書と内部文書を作成し、バイオインフォマティクスのトレーニングとセミナーを提供
  6. バイオインフォマティクスと計算生物学の研究分野におけるベストプラクティスと最新のトレンドの把握
  7. 意識的にかつオープンに情報をシェアし、信頼性と透明性のあるチーム文化へ貢献
  8. セクションリーダーによって割り当てられた、または要請されたその他の関連業務の遂行
応募資格

(必須)

  1. 生物学、生物情報学、計算生物学、コンピューターサイエンス、生物医工学などの関連分野の学士号と3年以上の実務経験、または同等の教育、トレーニング、経験の組み合わせを有すること
  2. Linux/Unix システムでのシェルスクリプトの経験を
  3. バイオインフォマティクスプログラミングで頻繁に使用される言語 (Python、Perl、R、および C/C++) のうち、少なくとも2つでのプログラミング経験
  4. ソフトウェア導入自動化ツール (Automake、Autoconf、(c)make、pip など) の経験
  5. オープンソースのバイオインフォマティクスデータベースとツールに関する一般的な知識
  6. Git、SVN、CVSなどのバージョン管理ツールを日常的な使用経験(Git推奨)
  7. 日本語または英語での口頭と文書による十分なコミュニケーション能力
    (※日本語が母国語の方は、TOEIC R&W スコア 600以上もしくは同等の英語力)
  8. ユーザーサポートの経験
  9. チームメンバーと良好な人間関係と信頼関係を築く能力
  10. 問題を特定し解決する能力
  11. 新しい技術、コンセプト、手法などを学び仕事に活かす能力

(尚可)

  1. Linux ベースのHPCシステムで解析ワークフローの実行経験
  2. 学術機関または研究環境での勤務経験
  3. 仮想化技術(Virtualbox、libvirt など)およびコンテナー (Docker、Singularity、Enroot など) の技術に関する知識
報酬・待遇

本学園の規程に基づき経験・能力に応じて支給する。
モデル年俸:500 - 900万円
*モデル年俸は募集職種の年俸レンジを示しています。実際の年俸額は本学園の規程に基づき経験・スキルに応じて決定されます。

応募書類
  • 履歴書及び職務経歴書(和文)
  • Cover Letter and Curriculum vitae(英文)
  • 推薦状(2通)(最終面接に進んだ際にご提出いただきます)

* 日本語が母語の方は、日本語の応募書類の提出は必須です。
* 採用情報を最初にどこでご覧になったか記載してください。

告知事項
職種
研究支援
採用予定日
できるだけ早期
雇用期間

常勤、3ヶ月の試用期間を含む2年間の任期制雇用
更新可(業績評価、勤務態度並びに本学の財務その他の状況により判断)

就業時間

9:00 - 17:30 専門型裁量労働制 (1日7時間30分働いたものとみなされる)
休憩時間:12:00 - 13:00
 

休日:
土・日・祝日,年末年始(12 月 29 日~1 月 3 日)

休暇:
年次有給休暇、夏季休暇、傷病休暇、特別休暇

時間外労働:
裁量制:
専門業務型裁量労働制により、7時間30分労働したものとみなされます。

レポート先
科学計算及びデータ解析セクションリーダー
就業場所
メインキャンパス:沖縄県国頭郡恩納村字谷茶 1919-1
応募期日
定員に達し次第終了。適任者を決定するまで継続します。
*定員に達し次第終了。また、書類を受領次第、選考を開始します。
問い合せ先